Enquanto a Quarta Guerra do Santo Graal prossegue sem um vencedor claro à vista, os Servos restantes e seus Mestres são chamados pelo supervisor da Igreja Risei Kotomine, a fim de se unirem e enfrentarem uma ameaça iminente que pode desvendar a Guerra do Graal e trazer o destruição da cidade de Fuyuki. A trégua desconfortável logo entra em colapso quando os Mestres demonstram que farão qualquer coisa em seu poder, por mais desprezível que seja, para vencer. Sementes de dúvida são semeadas entre Kiritsugu Emiya e Saber, seu Servo, como suas ideologias conflitantes no heroísmo e choque de cavalaria. Enquanto isso, um sinistro vínculo se forma entre Kirei Kotomine, que ainda busca encontrar seu propósito na vida, e um dos servos restantes. Como a contagem regressiva para o final da guerra chega a zero, o custo da vitória começa a embaçar a linha entre a vitória e a derrota.